1．宏观经济金融调控政策因素。
　　一是改革前农业集体组织、生产队各种名目的贷款，改革后已全部形成“无主”贷款。二是原来县、乡(镇)、村三级集体企业，在经济体制改革过程中倒闭或进行改制、重组等，使农村金融机构债务被悬空。三是从提倡大力发展多种经济形式和经济成分，到取缔“十五小”企业，造成农村金融机构债务无法落实。四是目前国家进行宏观经济调控，控制钢铁、水泥、电解铝等高能耗、高污染和“过热”行业发展规模和速度，压缩信贷，企业利润锐减，甚至已开始出现亏损，使银行信贷资金风险加大。
　　
　　2．地方性政策因素。
　　一是地方政府干预。二是地方综合治理。如河南省某市的安林公路综合治理，涉及农村金融机构贷款17033．7万元，可能造成重大损失的7460．7万元。三是农业经济政策不切实际。在地方农村经济政策指导下，各种示范园、种养基地及特色产业得到农村信用社的大力支持，由于市场原因和技术条件达不到，成功率很低，农村信用社的信贷资产质量下降。
　　
　　3．政策性遗留问题。
　　一是基层农发行成立之初，一些附营企业贷款未能向农行划转，这部分企业效益普遍不佳。二是财务挂账政策滞后。此部分财务挂账是收储企业在进行政策性收购过程中形成的挂账。对因政策界定执行等因素形成的应挂未挂贷款，以及这部分贷款在挂账后消化处理前，对农发行信贷资金构成较大风险。三是粮食顺价销售与供求状况错位，累积了信贷风险。国家为了保护农民利益，一方面对粮食继续实行政府定价、敞开收购的保护政策；另一方面为将收购的成本转嫁出去，减轻财政负担，企业收储的粮食必须实现顺价销售。但近几年粮食销售价格持续低迷，加之粮食消费的价格弹性低，敞开收购的品种与市场需求错位，在总体供大于求的情况下，即使以较低的价格也难以销售：“敞开收购”与“顺价销售”政策导致敞开收购一库存积压一陈化损失一不良贷款上升的恶性循环。虽然国家每年对保护价位下调的幅度与上年保护价与市场粮价平均价差幅度基本一致，力求降低成本，与市场接轨，但是，由于市场粮源未被垄断，保护价一直高于市场价，粮食库存整体实现顺价销售十分困难。陈化粮、陈次粮越来越多，加之市场变动，库存粮食严重贬值，占用贷款的潜在损失也与日俱增，成为农发行信贷风险的一大隐患。
　　(四)农村金融生态环境恶劣是阻碍基层农村金融机构提高资金使用效率的根本原因。
　　“逃废”银行债务问题依然严重；银行内控制度不落实，个别银行工作人员以贷谋私；政府干预仍然存在，权力部门个别工作人员利用职权介绍贷款。农村企业倒闭率较高，造成农信社风险。
　　
　　改善农村金融资金流动性管理和使用效率政策建议
　　
　　在健全的市场经济条件下，银行资金投放、收益与风险是正比例关系，银行资金投放的风险大小，都只是一种可能性而非必然性。然而，在目前的计划经济向市场经济过渡时期的农村金融市场中，贷款一旦向企业投放，形成的风险几乎就成为必然。在目前的农村市场经济条件下，农村金融机构单一地减少流动性资产，增加信贷资金投放，给自身带来的损失要远远大于自身所获得的收益。
　　(一)按既要保证资金的流动性又要尽可能地提高资金使用效率的原则加强内部资金管理：
　　一是正确处理上存资金与贷款和投资适度增长的关系。二是认真核定保证支付与库存和周转资金保持的适当比例，尽量减少不生息资金的占用比例。三是加大发展中间业务的资金使用量，提高中间业务收入。四是积极参与公开市场业务和开展货币市场业务，提高富余资金的利用率和使用效率。
　　(二)加强农村金融生态环境建设。政府应协调职能部门正确处理好发展地方经济与保全农村金融机构资产安全的关系。执法部门要对逃废农村金融机构债务责任人，依法追究其法律责任，提高信贷资产的社会保障系数。农发行应当成为资金回流农村的载体，包括中央银行的再贷款支持，财政支农资金与信贷资金的有机结合，以弥补市场缺陷。在合作性商业金融薄弱的领域，地方政府要为农村金融机构投资提供窗口指导。
　　(三)农村金融机构要加强对宏观经济走势、热点行业政策的前瞻性研究，为行业信贷调整、避免过度集中提供决策依据。
　　(四)优化资产结构，实现资产规模、结构、质量、发展速度的协调发展。经济资本管理是商业银行与国际惯例接轨的迫切需要，一方面，加大优质高效客户营销力度，提高新增贷款质量，稀释不良贷款占比；另一方面，加大存量贷款的贷后维护工作，避免正常类贷款的劣变，加快从低质量客户、高风险资产的退出，有效降低经济资本占用，提高经济资本回报率。
　　(五)建立有效的风险补偿机制。一是改革呆账准备金制度，目前呆账准备金计提只与贷款余额有关，而与贷款的内在损失程度无关，且呆账核销制度没有规范化、制度化，手续复杂，银行缺乏自主权。改革呆账准备金制度尤其必要：第一，呆账准备金制度的建立必须以审慎会计原则为基础，充分估计贷款可能发生的损失，同时准备金的计提必须及时、充分，并使之制度化。目前贷款分类制度已实施，应对不同类别的贷款按其风险程度不同提取不同比例的贷款呆账准备金。第二，建立对呆账准备金的评估制度。要定期对准备金的覆盖范围和充足性进行评估，及时增拨或减少准备金的数量，使之与贷款损失水平相适应。第三，建立呆账及时冲销制度。对损失的贷款，不应当长期反映在资产负债中，应当规定冲销的适当时限。对贷款的冲销要建立严格的、授权明确的审批制度。二是坚持“谁出政策谁负责”的原则，建立利益补偿机制，确保执行政策性业务的粮、棉企业能得到合理的补贴，不至于承担因政府行为造成的经济损失。三是建立贷款风险补偿机制，筹集粮食贷款风险准备金并按多方筹集、权属不变、银企共管、专款专用的原则提取和使用。
　　(六)及时调整经营思路，实现经济效益与社会效益的统筹兼顾。随着粮食流通体制改革，粮食市场已经放开，农村地区原有国有粮食收购企业，已全部改制为股份制企业。农发行必然由纯政策性银行逐步向商业化经营过渡。农发行应实行“政策性贷款商业化操作”，即政策性贷款在发放、管理和收回中必须坚持商业化管理。对发展前景好、资信程度高、经营管理水平高的企业，在资金供应和条件上放宽；反之，则应停止支持。由单纯追求社会效益，向追求社会效益和经济效益兼顾转变。